爱丁堡大学由三所主要学院组成,它们分别是:
艺术、人文与社会科学学院(College of Arts, Humanities & Social Sciences)
下设多个小学院,如商学院、爱丁堡艺术学院、神学院、经济学院等。
科学与工程学院(College of Science & Engineering)
包括生物科学学院、化学学院、工程学院、地球科学学院等。
医学与兽医学院(College of Medicine & Veterinary Medicine)
下设爱丁堡医学院和皇家(狄克)兽医研究院。
这些学院下面又各自包含多个系,提供240种学位课程。爱丁堡大学的医学院尤其著名,是世界上最古老的医学院之一,培养了多位世界知名的医学家